水生植物凈化系統是以生態學原理為指導，將生態系統結構與功能應用于水體凈化，因而采用水生植物凈化系統的景觀水池底部需要鋪設泥土，用于水生植物生長繁殖的基質。

鋪設泥土的水生植物凈化系統

江蘇省委的觀賞水池采用的水生植物凈化系統，由于基質土的長期懸浮，由于有魚存在，在魚和風的擾動下，底泥長期懸浮不沉淀，使觀賞水池變成了泥漿池，大大影響景觀效果，而凈化效果更是差強人意。