據鄱陽湖第二次科考的結果顯示，目前鄱陽湖在部分湖區已經發現有水華藍藻聚集現象，水面形成一層藍綠色，而且有腥臭味的浮沫。專家指出，藍藻有逐年加重的趨勢，若不加干預，讓藍藻大規模爆發，對鄱陽湖的生態系統危害極大。

其實藍藻的生長對環境要求很高，但是在這次的科考中卻發現，在鄱陽湖幾個相對靜止的湖區，已經形成了肉眼可見的藍藻水華漂浮聚集層。如果藍藻大量爆發，整個湖泊水里面的氧氣會被它們消耗掉。水里的含氧量減少，水生植物就無法進行光合作用會死掉，魚類，蝦類等這些生物也會死掉，所以藍藻成為優勢藻種，對于鄱陽湖的生態環境是極為不利的。

藍藻水華防治的基本指導思想是：盡量控制外源性（點源、面源）營養物質輸入；削減內源性營養物質的負荷；水化爆發前后應急除藻抑藻。以此，佳業佳境的生態控藻素能夠應急除藻抑藻，控藻素通過抑制植物光合作用除藻，對動物沒有任何影響。而水面垃圾及水華清除機則是通過直接消減營養物質的“載體”——藍藻，從根本上消除藍藻水華爆發的隱患。