微生物是一切肉眼看不見或看不清的微小生物的總稱。微生物的特點總結起來就是小（個體微?。⒑啠嬙旌唵危⒌停ㄟM化地位低）。

微生物分布廣，在自然界任何角落都有微生物的“身影”。水體中亦存在著大量的微生物，可分為非細胞形態的和細胞形態的兩大類，具體分類如下：

其中，大量的微生物具有氧化分解復雜有機物和某些無機物，并將這些物質轉化為簡單的物質，或將有毒物質轉化為無毒物質的能力。這些微生物可被利用于廢水處理上，稱之為（微）生物處理法。

水體的污染物包括蛋白質、氨基酸、油類等好氧有機物，酸、堿等無機物，汞、砷、鉛等重金屬元素，鉀鹽、銨鹽等植物營養源，有機磷農藥、有機氯農藥等有毒有機物，寄生蟲、細菌等微生物。而廢水中需要去除的污染物如蛋白質、氨基酸、氮磷等營養物質恰好是微生物的營養源，微生物在生命活動的過程中，將廢水中營養鹽的一部分用于合成細胞的原生質和貯藏物；一部分則變為代謝產物，并釋放出能量，供給微生物原生質的合成和生命活動，使自身不斷地生長繁殖，從而使廢水得到凈化。另外，海藻、真菌或細菌等微生物可以吸附汞、砷、鉛之類的重金屬元素，減少水體中重金屬的含量。

水處理中微生物種類多、分布廣、數量大、形體小、代謝能力強、繁殖快、容易發生變異，這些特性使微生物能夠更為高效的吸收并降解有機物、去除水體臭味、去除重金屬離子等。同時，部分微生物也可作為指示生物來反應水質情況。

如今，污水處理廠多采用生物法處理污水，如活性污泥法、生物膜法、穩定塘等。污水生物處理是微生物在酶的催化作用下，利用微生物的新陳代謝功能，對污水中的污染物質進行分解和轉化。HDP直接凈化技術則是采用的是“流水不腐+曝氣充氧+微生物修復”三位一體，對景觀水、河道水等進行生態修復，實現水體凈化。